Postdoktor inom populationsgenomik, anpassning hos lantsorter av råg

01Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi

Bli en del av Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi vid Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) i en tvåårig postdoktorsanställning där du använder populationsgenomik för att ta reda på hur råg anpassar sig till olika miljöer och vilken roll dess mikrobiota spelar. Du kommer att leda det genomiska arbetet i projektet ’Eko-evolution av råg och dess mikrobiella allierade’, finansierat av Vetenskapsrådet, och även utföra en del fältarbete och växthusstudier.

02Om jobbet

Råg (Secale cereale L.) odlas där andra sädesslag har svårt att klara sig eftersom råg bättre tål kyla, torka och näringsfattiga jordar. Till skillnad från sina nära släktingar vete och korn är råg korsbefruktande, vilket gör att den kan behålla en hög genetisk mångfald. Det gör råg till ett kraftfullt modellsystem för att förstå om mikroorganismer bidrar till hur växter anpassar sig till sin miljö, och hur domesticeringen har stört detta samspel. Lantsorter av råg är dessutom på väg tillbaka på gårdarna, vilket gör att vi kan studera levande populationer på de platser som har format dem, i stället för att enbart förlita oss på genbanksmaterial.

Du kommer att studera rågpopulationer som sträcker sig från vilda och ogräsartade släktingar till lantsorter och inavlade högavkastande sorter. Dina huvudsakliga arbetsuppgifter blir att:

• samla in frö från rågpopulationer i norra Europa, odla dem under standardiserade förhållanden i växthus samt karakterisera deras fysiologiska och fenologiska egenskaper och tillhörande mikrobsamhällen
• analysera data från helgenomsekvensering för att beskriva den genetiska mångfalden och populationsstrukturen hos rågpopulationerna
• koppla genomisk variation till växtegenskaper, mikrobsamhällen och miljö för att identifiera drivkrafter bakom anpassning, till exempel genom genom-miljö-associationsanalyser
• Du kommer att arbeta i forskargruppen för markmikrobiologi vid Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi, som fokuserar på att förstå vilken roll mikroorganismer spelar i biogeokemiska processer. Du kommer också att ingå i ett bredare nätverk av samarbetspartner som stöttar det genomiska arbetet, bland annat evolutionsbiologer vid Uppsala universitet och specialister på grödgenomik vid University of Melbourne i Australien.

03Din bakgrund

Vi söker dig som har doktorsexamen i biologi med inriktning mot populationsgenetik, evolutionsbiologi, bioinformatik, ekologi, lantbruksvetenskap eller ett närliggande område, och som har dokumenterad förmåga att bedriva självständigt vetenskapligt forskningsarbete och att skriva vetenskapliga publikationer. Vi ser också gärna att du är mycket motiverad, öppen för nya perspektiv och trivs med att arbeta i team, och att du vill bidra positivt till forskningsmiljöns utveckling.

04Krav

• erfarenhet av att analysera data från högkapacitetssekvensering för populationsgenomik, från rå sekvenseringsdata till analyser på populationsnivå
• erfarenhet av att arbeta via the command line i ett beräkningskluster samt av skriptprogrammering, till exempel i bash, R eller Python
• goda kunskaper i engelska i tal och skrift, för vetenskapligt skrivande, rapportering och deltagande i internationella projektaktiviteter

05Det är meriterande om du har

• erfarenhet av data från helgenomsekvensering, särskilt från stora genom
• erfarenhet av att koppla genomisk variation till egenskaper eller miljö
• kunskap om evolutionära och ekoevolutionära processer hos växter
• erfarenhet av att arbeta med växter eller data om mikrobsamhällen
• körkort
• Vi förväntar oss inte att du har alla dessa meriter. Om din erfarenhet av genomik kommer från ett annat studiesystem är du mycket välkommen att söka, och vi stöttar dig i att lära dig arbetet med växter och mikroorganismer.
•  

Anställningen som postdoktor är avsedd för en forskare tidigt i karriären. Vi söker därför främst personer som har avlagt doktorsexamen högst tre år före sista ansökningsdag. Om din examen är äldre på grund av föräldraledighet, sjukdom, fackliga uppdrag, militärtjänstgöring eller liknande omständigheter, ange detta i din ansökan. Om du är nära att slutföra din forskarutbildning är du välkommen att söka, förutsatt att doktorsexamen är avlagd innan beslut om anställning fattas.

Vid bedömningen läggs även vikt vid personliga egenskaper, såsom förmåga att samarbeta, arbeta självständigt och kommunicera tydligt.

06Om oss

Institutionen för skoglig mykologi och växtpatologi vid SLU har en framstående internationell position inom forskning. Vi bedriver både grundläggande och tillämpad forskning med fokus på de viktiga interaktionerna mellan växter, svampar och andra mikroorganismer i skogs- och jordbrukssystem. Våra huvudsakliga forskningsområden är skoglig och agrar växtpatologi, interaktioner mellan växter, mark och mikroorganismer, mikrobiell och molekylär ekologi, jämförande genomik samt biologisk bekämpning. Vi arbetar med angelägna frågor som förlust av biologisk mångfald, försämrade ekosystemfunktioner och effekterna av inhemska och invasiva skadegörare och sjukdomar. Vårt arbete syftar till att utveckla hållbara metoder inom jord- och skogsbruk, särskilt i ett förändrat klimat, för att minimera miljöpåverkan och ekonomiska förluster.

Mer information om institutionen/avdelningen:  http://www.slu.se/mykopat

Mer information om projektet: https://www.slu.se/en/research/research-catalogue/projekt/e/eco-evolution-of-rye-and-its-microbial-allies/

Bland förmånerna finns föräldrapenningtillägg, hälso- och sjukvårdsförmåner och friskvårdsbidrag. Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba vid SLU på https://www.slu.se/om-slu/jobba-pa-slu/

07Placering

Uppsala

08Anställningsform

Tidsbegränsad anställning 24 månader, med möjlighet till förlängning.

09Omfattning

100%

10Tillträde

Våren 2027 eller enligt överenskommelse.

11Ansökan

Välkommen med din ansökan via ansökningsknappen nedan senast 2027-01-07. Den 20-22 november går det inte att skicka in ansökningar via rekryteringssystemet på grund av en systemuppdatering.

12Ansökan ska skrivas på engelska och innehålla följande dokument

• Personligt brev (högst 1 sida) där du beskriver din erfarenhet av populationsgenomik och vad som intresserar dig med projektet
• CV (länka gärna till offentligt tillgänglig kod eller data)
• Namn och kontaktuppgifter till två referenspersoner
• Doktorsexamensbevis (om du ännu inte har disputerat, ange i stället planerat datum för disputationen)

Intervjuer planeras till januari 2027.